Бацькі Міхаіла, верагодна, пазнаёміліся ў верасні 1637 года падчас цырымоніі каранацыі Цэцыліі Рэнаты, жонкі караля Уладзіслава IV Вазы. Яны заручыліся 13 лютага 1638 года, але не надавалі гэтаму значэння з-за жалобы Грызельды па яе бацьку, Томашу Замойскаму, які памёр 7 студзеня. Іх вяселле адбылося ў Замосце 27 лютага 1639 года.
У 1640 годзе немаўля Міхаіла павезлі ў Замосце, дзе яго да 1642 года выхоўвала бабуля, Катажына Замойская, народжаная Астрожская. Пасля гэтага ён жыў з маці, спыняючыся ў Лубна, Пшылуку, белым камені і Вішняўцы на Валыні. У 1648 годзе Міхаіл і яго бацькі, выгнаныя з памежжа, пераехалі ў Брагін, затым у тураў, а да восені 1648 года апынуліся ў крэпасці Замосце.
У 1651 годзе памёр яго бацька, пакінуўшы большую частку сваёй маёмасці ў чужых руках, а яго маёнткі ў Рутэніі і Валыні былі спустошаныя вайной і абцяжараныя абавязкамі. Першы час Міхаіл знаходзіўся пад абаронай біскупа Вроцлаўскага і плоцкага, князя Карла Фердынанда Вазы, у падзяку за дапамогу, аказаную яго бацькам у 1648 годзе. Міхаіл жыў у рэзідэнцыі біскупа ў Броку, атрымліваючы адукацыю ў езуітаў. Пасля смерці біскупа ў 1655 годзе яго дзядзька Ян Сабепан Замойскі, які стаў пасля сандамірскім ваяводам, узяў апеку над Міхаілам і забяспечыў яго далейшую адукацыю. Пазней ён далучыўся да каралеўскага двара Яна Казіміра, дзе заваяваў размяшчэнне.
Падчас шведскага патопу Міхаіл і каралеўская пара знайшлі прытулак у замку Опперсдорф у Глоговеке блізу Прудніка ў Сілезіі. 18 лістапада 1655 года, прытрымліваючыся загаду караля Яна Казіміра, ён пераехаў у Нысу, дзе заставаўся прынамсі да сакавіка 1656 года, наведваючы езуіцкі каледж Каралінум.
У 1656 годзе, пры падтрымцы каралевы Людвікі Марыі, Міхаіл пачаў навучанне ў Карлавым універсітэце ў Празе. Яго прэцэптар, Феліцыян Дунін Вансовіч, пастаянна інфармаваў ардынарыя Замойскага аб поспехах Міхаіла ў вучобе. Аднак у 1660 годзе каралева абвінаваціла Вансовіча ў празмерных выдатках і вырашыла вярнуць Міхаіла ў Польшчу. Яго будучыню павінен быў вызначыць выхавальнік, зыходзячы з яго здольнасцяў. Міхаіл вярнуўся ў Польшчу да 19 чэрвеня 1660 года.
Неўзабаве ён наведаў двары Дрэздэна і Вены, дзе набыў асаблівую добразычлівасць ўдавее імператрыцы Элеаноры. За гэты час ён дасягнуў звання палкоўніка і, магчыма, імператарскага камергера. Верагодна, менавіта тут ён сустрэў сваю будучую жонку Элеанору, якая тады была яшчэ дзіцем (нарадзілася ў 1653 годзе). У Вене ён авалодаў латынню, нямецкай, італьянскай і французскай мовамі.
Міхаіл гаварыў на некалькіх мовах: латынь, нямецкая, французская, італьянская, іспанская, татарская, турэцкая і, верагодна, русінская. Яго лінгвістычныя таленты былі адзначаны гісторыкамі.
Кандыдатура Міхаіла Карыбута на прастол Рэчы Паспалітай была прапанаваная біскупам Хелмскім і падканцлерам каронным Анджэем Альшоўскім. Да яго дабраволілі многія шляхцічы, якія бачылі ў ім небагатага і неспрактыкаванага князя, які не будзе пагражаць іх залатой свабодзе. Адразу пасля абрання супраць яго выступіла прафранцузская магнацкая партыя на чале з прымасам Мікалаем Пражмоўскім і вялікім гетманам кароны Янам Сабескім, якая планавала ануляваць вынікі выбараў і пасля зрынуць Міхаіла.
Ён быў абраны каралём на выбарчым парламенце 19 чэрвеня 1669 года. Нягледзячы на чатырох іншых кандыдатаў розных нацыянальнасцяў, дваране, насцярожана адносяцца да замежных манархаў, пераважнай большасцю прагаласавалі за" Пяста", насуперак намерам магнатаў. Ён атрымаў 11 271 выбарчы голас ад дваран.
6 ліпеня ён прынёс прысягу, а 29 верасня 1669 года быў каранаваны ў Кракаве. Каранацыйны працэс завяршыўся датэрмінова 5 лістапада, сарваны Янам Аляксандрам Олізарам, які пратэставаў супраць затрымак двара ў выплаце кампенсацый украінскім выгнаннікам і выдзяленні вакантных старостваў.
27 лютага 1670 года Міхаіл ажаніўся на Элеаноры Габсбург у Яснай Гары, прычым цырымонію праводзіў папскі нунцый Галеаца Марэскоці, паколькі прымас Пражмоўскі адмовіўся ўдзельнічаць у ёй. Першыя вясельныя ўрачыстасці праходзілі ў палацы Дэнхофа ў Крушыне.
У гэты перыяд за ўладу ў Рэспубліцы змагаліся дзве фракцыі: незадаволеныя і рэгалістаў. Да незадаволеных, таксама вядомых як прафранцузская партыя, адносіліся прымас Мікалай Ян Пражмоўскі, вялікі гетман кароны Ян Сабескі, Анджэй Морштын, Багуслаў і Міхаіл Радзівілы, ваявода Кракаўскі Аляксандр Міхал Любамірскі, ваявода Рутэнскі Станіслаў Ян Яблоноўскі і ваявода познаньскі Кшыштаф Гжымултоўскі.
У лістападзе 1669 года зласліўцы сарвалі каранацыйны сойм, выкарыстоўваючы эксулянтаў - шляхцічаў з украінскіх зямель, якія адышлі да Расіі. Іх мэтай было звяржэнне караля і ўзвядзенне на прастол графа Карла-Парыжа д'арлеан-Лангевіля. Па ўсёй краіне распаўсюдзіўся паклёпніцкі памфлет супраць караля, напісаны Янам Велікапольскім, вялікім магістрам кароны, пад назвай"ліст польскага шляхціца свайму суседу пасля Кракаўскага каранацыйнага сейма 1669 года".
У 1672 годзе Турцыя абвясціла вайну рэспубліцы, але ў кароне наспявала чарговая грамадзянская вайна. Дваране, сабраныя каралём у Голубе, утварылі Голубскую канфедэрацыю пад кіраўніцтвам кароннага палявога пісара Стэфана Станіслава Чарнецкага. Гэтая канфедэрацыя пагражала прымасу Мікалаю Пражмаўскаму судом, пазбавіла яго ўсіх дзяржаўных пасад і разрабавала маёнткі Яна Сабескага і яго сваякоў. 22 лістапада ў Кобрыне літоўскае войска ўтварыла канфедэрацыю, якая ўстала на бок Сабескага. Армія Кароны, якая знаходзілася разам з Сабескім у Шчэбжэшыне, утварыла Шчэбжэшынскую канфедэрацыю ў яго абарону. Сабескі павёў свае войскі да Ловіча, дзе знаходзіўся прымас Пражмоўскі.
Пасрэдніцкія намаганні Апостальскага Нунцыя Франчэска Бонвизи і кракаўскага біскупа Анджэя Тшебицкого, дапамаглі улагодзіць сітуацыю. У сакавіку 1673 года парламент па супакаенні ў Варшаве прыняў рэзалюцыі, якія ўключалі ўзаемнае прабачэнне віны, адмову ад ратыфікацыі Бухачского дагавора і ўвядзенне прызыўных фондаў для войска, а таксама вылучэнне грошай ад папы на артылерыю.
Кароль Міхал Карыбут Вішнявецкі памёр ад атручвання страўніка ў архіепіскапскім палацы ў Львове 10 лістапада 1673 года. Новым каралём 19 мая 1674 года быў абраны Ян III Сабескі. Пасля смерці сэрца караля Міхала было пахавана ў Камальдольскім манастыры ў Белянах (Варшава). Яго вантробы былі пахаваныя ў сценах лацінскага сабора ў Львове, а цела было перавезена ў Варшаву 20 лістапада.
Астанкі караля Міхала былі пахаваныя разам з прахам Яна II Казіміра Вазы ў падвалах Вавельскага сабора 31 студзеня 1676 года, у той жа дзень, калі быў каранаваны яго пераемнік, Ян III Сабескі. Першапачаткова яго астанкі былі пахаваныя ў Свентакшыскай капліцы, а ў 1858 годзе перанесены ў крыпту Святога Леанарда ў Вавельскім замку і змешчаны ў саркафаг з чорнага мармуру, замоўлены ў 1857 годзе імператарам Францам Іосіфам I Аўстрыйскім і каралём Францам Іосіфам Галіцкім, пра што сведчыць надпіс на грабніцы.
Калі ў 1938 годзе саркафаг быў адкрыты, у ім знаходзіўся дубовы труну з парэшткамі караля, загорнутымі ў залатыя адзення, бляшаная трубка з дакументам, які пацвярджае перанос у 1858 годзе са Свентакшыскай капэлы ў крыпту Святога Леанарда, драўляны скіпетр і рэшткі драўлянай труны з плюшавай абіўкай.
